Poltekkes Kemenkes Medan merupakan penggabungan dari 7 (tujuh) Akademi Kesehatan yang sudah ada sebelumnya yaitu Akademi Keperawatan, Akademi Kebidanan, Akademi Kesehatan Gigi, Akademi Farmasi, Akademi Analis Kesehatan, Akademi Gizi dan Akademi Kesehatan Lingkungan. Pada Tanggal 10 Oktober tahun 2012 berdasarkan SK Nomor 355/E/O/212/ 2012 Poltekkes Kemenkes Medan tentang Alih Bina Penyelenggaraan Program Studi dari Kementerian Kesehatan ke Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan.
Dalam rangka meningkatkan kinerja pelayanan pada semua bidang, Poltekkes Kemenkes Medan menerapkan Pengelolaan Keuangan Badan Layanan Umum (PK-BLU), berdasarkan SK Menteri Keuangan RI No. 500/KMK/05/2009 tanggal 17 Desember 2009. Sesuai dengan perkembangan pengelolaan Poltekkes Kemenkes Medan saat ini menyelenggarakan pendidikan pada 7 Jurusan dengan 19 PS, terdiri atas 13 (tiga belas) PS Diploma Tiga, 4 (empat) PS Sarjana Terapan, serta 2 (dua) PS Pendidikan Profesi.